Филогенетика раскрывает происхождение воши млекопитающих от Afrotheria

  • Уилсон Д., Миттермер Р.А., Каваллини Б. Путеводитель по млекопитающим мира об. 1 (Рысь Эдисионс, 2009 г.).

  • Мередит, Р.В. и др. Влияние мелового извержения и вымирания KPg на разнообразие млекопитающих. наук 334521-524 (2011).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Дос Рейс, М. и др. Эволюционные наборы данных обеспечивают точность и достоверность оценки временной шкалы филогении плацентарных млекопитающих. Брук. Р. Соц. Б 2793491-3500 (2012).

    Статья Google Академии

  • О’Лири, М.А. и соавт. Плацентарный предок млекопитающих и постплацентарное излучение K-Pg. наук 339662-667 (2013).

    Статья Google Академии

  • Апхэм, Н. С., Эссельстин, Дж. А. и Джетц, В. Вывод о дереве млекопитающих: группы происхождения на уровне видов для вопросов экологии, эволюции и сохранения. Плюс биол. 17e3000494 (2019).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Мерфи, В.Дж., Фоли, Н.М., Бредемейер, К.Р., Гейтси, Дж. и Спрингер, М.С. Филогеномика и генная инженерия плацентарного излучения млекопитающих. Анну. Преподобный Аним. Бьюски. 929-53 (2021).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Альварес-Карретеро, С. и др. Хронология эволюции млекопитающих на уровне видов, включающая данные относительной эволюции. вспыльчивый характер 602263–267 (2022).

    Статья Google Академии

  • Ким, Канзас Коэволюция паразитических членистоногих и млекопитающих (Уайли, 1986).

  • Джонсон, КП и др. Одновременное излучение птичьих и млекопитающих за границу К-Пг. биол. лат. 1420180141 (2018).

    Статья Google Академии

  • Деревья Hafner, MS и Nadler, SA поддерживают совместную эволюцию паразитов и их хозяев. вспыльчивый характер 332258-259 (1988).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Huelsenbeck, JP & Rannala, B. Филогенетические и филогенетические подходы к возрасту: проверка гипотез в эволюционном контексте. наук 276227-232 (1997).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Пейдж, РДМ и Чарлстон, Массачусетс Деревья внутри деревьев: эволюционная наука и исторические ассоциации. Тенденции экол. Эвол. 13356–359 (1998).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Нибердинг, К.М. и Оливьери, И. Паразиты: агенты линии хозяина и окружающей среды? Тенденции экол. Эвол. 22156–165 (2007).

    Статья Google Академии

  • Аллен, Дж. М., Уорман, CO, Лайт, Дж. Э. и Рид Д. Л. в Успехи приматологии: прогресс и перспективы об. 38 (Редакторы: Бринкворт, Дж. и Печенкина, К.) 161–186 (Springer, 2013).

  • Клейтон, Д. Х., Бош, С. Е. и Джонсон, К. П. Эволюция жизни на хозяевах: интеграция экологии и истории (Чикагский университет Press, 2015).

  • Альтхофф, Д.М., Сегрейвс, К.А. и Джонсон, и тест MTJ на коэволюционную диверсификацию: связь модели с процессом. Тенденции экол. Эвол. 2982–89 (2014).

    Статья Google Академии

  • Хейворд А., Пулин Р. и Накагава С. Крупномасштабный анализ эволюции кофилогенеза симбионтов-хозяев выявляет движущие силы филогенетической конгруэнтности. Экол. лат. 241681–1696 (2021).

  • Прайс, Р.Д., Хелленталь, Р.А., Пальма, Р.Л., Джонсон, К.П. и Клейтон, Д.Х. Жевательные вши: общий контрольный список и биологический обзор (Обзор естественной истории штата Иллинойс, 2003 г.).

  • Дерден, Л.А. и Массер, Г.Г. Сосущие воши (Insecta, Anoplura) мира: таксономический контрольный список с записями о хозяевах млекопитающих и географическом распространении. (Американский музей естественной истории, 1994 г.).

  • Де Мойя, Р.С. и др. Филогенетика паразитических и непаразитических вшей (Insecta: Psocodea): объединение данных о последовательности и поиск решений композиционной предвзятости в наборах данных следующего поколения. система. биол. 70719-738 (2021).

    Статья Google Академии

  • Рид, Д.Л., Лайт, Дж.Э., Аллен, Дж.М. и Кирчман, Дж.Дж. Пара потерянных вшей или выздоровевших паразитов: история эволюции человеческой вши-примата. БМС Биол. 57 (2007).

    Статья Google Академии

  • Лайт, Дж. Э., Смит, В. С., Аллен, Дж. М., Дерден, Л. А. и Рид, Д. Л. Эволюционная история сосущих вшей млекопитающих (Phthiraptera: Anoplura). БМС Эвол. биол. 10292 (2010).

    Статья Google Академии

  • Бальбуэна, Х. А., Мигес-Лозано, Р. и Бласко-Коста, И. PACo: новое приложение Procrustes к кофилогенетическому анализу. ПЛЮС ОДИН 8e61048 (2013).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Сантичайвекин С. и соавт. eMpress: систематический инструмент для примирения между воспитанием семьи. биоинформатика https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa978 (2020 г.).

  • Бойд, Б. М. и соавт. Распространение голубей и голубей на большие расстояния создало новые экологические возможности для смены хозяина и адаптивной радиации их паразитами. Брук. Р. Соц. Б https://doi.org/10.1098/rspb.2022.0042 (2022 г.).

  • Катанах, Т.А. и Джонсон, К.П. Независимое происхождение перьевых вшей (Insecta: Дегерелла) хищных птиц. биол. Джей Линн. компания 114837-847 (2015).

    Статья Google Академии

  • Де Мойя, Р.С. и др. Обширная передача пернатых вшей от хозяина после массового вымирания в меловой и палеогеновый периоды. общий. биол. 2445 (2019).

    Статья Google Академии

  • Хафнер, М.С. и соавт. Различные скорости молекулярной эволюции у обычных хозяев и паразитов. наук 2651087-1090 (1994).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Пейдж, RDM (редактор) Запутанные деревья: наука об эволюции, спаривании и коэволюции (Чикагский университет, 2003 г.).

  • Аллен, Дж. М., ЛаФранс, Р., Фолк, Р. А., Джонсон, К. П. и Гуральник, Р. П. aTRAM 2.0: улучшенный и гибкий позиционный сборщик данных NGS. Эвол. Биоинформ. 141176934318774546 (2018).

    Статья Google Академии

  • Джонсон, К.П., Векштейн, Дж.Д., Эррера, С.В. и Донья, Дж. Взаимодействие между биогеографией хозяина и филогенезом в структурировании диверсификации рода перьевых вшей. Бенинермос. торговый центр. филогения. Эвол. 165107297 (2021).

  • Слейтер, ГСК и Берни, Э. Механистическая генерация выводов для сравнения биологических последовательностей. БМК Биоинформ. 631 (2005).

    Статья Google Академии

  • Katoh, K. & Standley, DM MAFFT Multiple Sequence Alignment Software, версия 7: улучшения производительности и удобства использования. торговый центр. биол. Эвол. 30772-780 (2013).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Капелла-Гутьеррес, С., Силья-Мартинес, Х.М., и Габальдон, Т. биоинформатика 251972-1973 (2009).

    Статья Google Академии

  • Минь, Пкео и др. IQ-TREE 2: Новые модели и эффективные методы генетического вывода в эпоху генетики. торговый центр. биол. Эвол. 371530-1534 (2020).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Дегнан, Дж. Х. и Розенберг, Н. А. Диссонанс генетического дерева, филогенетический вывод и слияние нескольких видов. Тенденции экол. Эвол. 24332-340 (2009).

    Статья Google Академии

  • Чжан, К., Раби, М., Сайяри, Э. и Мирараб, С. ASTRAL-III: Реконструкция дерева полиномиальных видов из частично разрешенных генных деревьев. БМК Биоинформ. 19153 (2018).

    Статья Google Академии

  • Ронквист, Ф., Лартильо, Н. и Филлипс, М.Дж. Преодоление разрыва между камнями и часами с использованием полного датирования свидетельств. Слон. Через. Р. Соц. Б 37120150136 (2016).

    Статья Google Академии

  • Лежандр П., Дедевиз Ю. и Базен Э. Статистический тест коэволюции хозяина и паразита. система. биол. 51217-234 (2002).

    Статья Google Академии

  • Смит, В.С. и соавт. Множественные штаммы вшей проходят через границу K-Pg. биол. лат. 7782-785 (2011).

    Статья Google Академии

  • Джонсон, КП и др. Филогенетика и эволюция полунасекомых. Брук. Наталь акад. наук. Соединенные Штаты Америки 11512775-12780 (2018).

    Статья CAS Scholar от Google

  • Paradis, E. & Schliep, K. ape 5.0: среда для современной генетики и эволюционного анализа в R. биоинформатика 35526-528 (2018).

    Статья Google Академии

  • Leave a Comment